.gitignore

Проблему попадания в репозиторий нежелательных файлов и директорий решает специальный настроечный файл git, который называется .gitignore. Его необходимо создать в корневой директории репозитория.

Держите свой репозиторий в чистоте. Хранить в репозитории временные файлы, которые генерируются локально не правильно.

Документация по .gitignore

Структура директорий UE

Простейший .gitignore файл, которого достаточно для большинства проектов UE, имеет вид:

.vs
*.sln
DerivedDataCache/
Intermediate/
Saved/
Binaries/
Build/

Можно воспользоваться обобщенным .gitignore файлом для UE.